宋庆元六年，铁木真与王汗会于萨里川(今蒙古克鲁伦河上游之西)，大败泰赤乌与蔑儿乞联军，首领塔儿忽台等被杀，沆忽阿忽等遁入巴儿忽真隘。宋嘉泰元年(1201年)，铁木真又在呼伦贝尔海剌尔河支流帖尼河之野(亦称帖尼火鲁罕，即今海拉尔河支流莫尔根勒河)，击败以札木合为首的塔塔儿、弘吉剌、合答斤等十一部联军，史称“帖尼河之战”。宋嘉泰二年，铁木真与王汗联军又在阔亦田(亦称阙奕坛，今呼伦贝尔哈拉哈河上源一带)最终击败了札木合同乃蛮、泰赤乌、塔塔儿、蔑儿乞等联军，取得了阔亦田之战的胜利。接着招降了呼伦贝尔一带的弘吉剌惕等部。至此，西起斡难河上流，东至大兴安岭以西的蒙古高原，都被铁木真控制了。从此，铁木真在争夺汗权之战中，他的领袖地位已成定局，少数不服从他的人如札木合，不能立足，只好带着少数部属，离开驻牧地，往依王汗。此后，成吉思汗统一蒙古各部之战，进入第二阶段。其主要之战有：宋嘉泰三年的合兰真沙陀、折折运都山之战，宋嘉泰四年的纳忽山、不黑都儿麻之战，最后平定蒙古高原，统一蒙古各部，成吉思汗最终成为全蒙古的可汗。

在第一阶段中，札木合势力的衰败，铁木真汗权地位的巩固，在蒙古草原上形成了蒙古部铁木真、克烈部王汗、乃蛮部太阳汗三足鼎立的局面。克烈部首领王汗在札木合的挑拨下，与铁木真的矛盾日益加深。三年，王汗率大军与铁木真战于合兰真(今流入贝尔池之哈驻哈河)，铁木真因寡不敌众而败，但败而不馁，不久，又重整军马，乘敌不备突袭包围王汗的窝鲁朵城(今蒙古鄂尔浑河上游，哈尔和林之北)营地。经过三天三夜的激战，终于攻灭了强大的克烈部。接着，铁木真消灭了四部塔塔儿，占领了呼伦贝尔高原。次年，大会于帖蔑延客额儿(今土拉河上游，肯特山之西)商议伐乃蛮。王汗的覆灭，使太阳汗震恐；他急忙纠集被铁木真击溃的札木合残部及泰赤乌、蔑儿乞等部残余势力，共同进攻铁木真。四年春，铁木真率大军西进，太阳罕亦领兵东进，两军决战于蒙古中部的杭海岭(今杭爱山)察乞儿马兀惕，太阳罕受伤被擒，不久死去，乃蛮联军大败。铁木真攻灭乃蛮南部太阳罕部，乘胜追击太阳罕子屈出律、札木合、蔑儿乞惕。

残余的蒙古部贵族的势力和蔑儿乞三部之余众，相继被征服。一直与铁木真为敌的札木合，被随从缚送铁木真，被铁木真赐以自尽；漠南汪古部首领遣使献降，斡亦剌部首领忽都合别乞也向铁木真投降。开禧二年(1206年)春，又越阿勒台山(今阿尔泰山)，进入乃蛮北部兀鲁黑塔黑地区(今蒙古科布多，巴彦乌列益等省)。其汗不欲鲁汗正猎于豁黑兀孙河(即索果克河)上，不意兵至，被擒，乃蛮北部亦亡。屈出律无所依，与脱黑脱阿西逃入额尔的失河(今额尔齐斯河)。至此，铁木真完成了中国蒙古草原的统一。铁木真在斡难河源，召开贵族官长大会，建立了蒙古汗国，被尊称为成吉思汗(意为强盛伟大的君主)。

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