康熙元年(1662年)七月,郑成功病死,郑经尚据驻厦门,清政府派都司王维明、总兵林中等人前往劝说郑经“朝廷诚信待人,若释疑遵制,削发登岸,自当厚爵加封”。此时,郑经尚奉南逃的明永历为正朔,但却又要求清政府依照朝鲜例,准其只对清廷纳贡而已。朝鲜是清朝的属国,郑经的态度,已把台湾视为独立于华夏之外的国家,叛国行径由此开始。
清政府虽看到郑经叛国,企图割土分地,但仍坚持争取的态度。再派林忠等人到厦门,诚恳希望郑经明晓大义,派人去漳州议和。郑经见清廷催迫甚急,经与属官密商,打算乘受抚谈判之机,整兵入台,长期占据台湾。正如郑经所言:“逆之,则指日加兵,内外受困,岂不危哉!不如暂借招抚为由,俟余整旅东平(指台湾)再作区处。”于是,郑经伪造了土地、户籍、军械等账册及攻城抢得的清朝印信等,一边佯称献地受抚,接受谈判,一边率师入台。果然,郑经人台后立即宣布拒绝谈判,坚持台湾为一独立国家,只向清廷纳贡。
清政府见郑经宣布受抚,而又率部入台,知其“归顺是假”。随后,清廷命福建总督李率泰进攻被郑经占据的厦门,郑经则由台湾返回福建,与清兵交战。郑经一战败北,丢掉厦门,退守铜山。清廷则让李率泰停止进攻,至铜山再次招抚。而郑经仍坚持叛国立场,表示如不让其独立治台“虽死不允”!
康熙五年(1666年),招抚大臣孔元章上疏清廷,建议以投诚将领和郑经在大陆的亲戚为说客,至台湾说服郑经,清廷允准。于是,孔元章选择郑经的投诚部将数人,持郑经舅父董班舍亲笔信,由招抚使刘尔贡、马星率领,赴台劝降。康熙六年五月,招抚人员赴台湾,七月返回,带回了郑经分别给孔元章和其舅父的书信,这两封书信进一步表明了郑经割据台湾的立场。给孔元章的书信中郑经强调台湾已“非属中国版图”,他做台湾皇帝“王侯之贵固吾所自有,万世之基已立于不拔”。让清政府以平等国待之,互通信使,互相通商,方可使“彼此无虞,波浪不惊”。致其舅父的信中更明白宣称:“今日东宁(指台湾),乃版图之外,另辟乾坤,幅帧数千里,粮食数十年……何羡于中土哉!”并说,清政府若以苍生为念,应“以外国之礼见待”,否则,只能是白费气力。其分割台湾野心昭著,气焰十分嚣张。
第二年,孔元章认为郑经仍有招抚希望,要求亲自赴台谈判。康熙允准后,在台一个月,无功而返。
康熙八年(1669年),康熙清除鳌拜集团,亲理朝政,对台湾问题仍然主张招抚。派刑部尚书明珠、兵部侍郎蔡毓荣至泉州与靖南王耿纪茂商量招抚之事,随后派员持诏书至台湾。而郑经拒不接旨,强调台湾“远在东海之外,与中国版图渺不相涉”。
康熙十二年(1673年),吴三桂叛乱,集数十万军队北犯。郑经应吴三桂之约率兵由台湾攻袭东南沿海,占领漳州、泉州、潮州、惠州等城。康熙派康亲王杰书率军入闽,夺回了漳、泉,汀三州,但仍派员与盘踞厦门的郑经谈招抚问题。郑经根本不听招抚条件,回函直言“幸遇诸藩举义,诚欲向中原共逐鹿,……人心思汉,则此一戎旅(指自己的部队)反可转祸为福!”杰书读信后,再派属员去厦门,要求郑经回到台湾,不要掺和在吴三桂的叛乱之中。郑经不思改悔,坚持不退兵,福建总督姚启圣指挥部队攻克漳、泉所属各县,郑军大败。随后,姚启圣再次奉劝郑经:前所提条件朝廷多已允准,与其在闽与朝廷争地,不如回台湾做你的草头王。郑经仍不理睬。