曾国荃得知城内粮食耗尽、火药用完后，加紧在天京城外挖地道，埋进万斤炸药。1864年7月19日，只听“轰”的一声，地动山摇中，地道炸药炸开了天京城墙，在隆隆的炮声和阵阵喊杀声中，天京城破。在一片混乱当中，章王林绍璋投河自尽，顾王吴汝孝上吊自杀。

　　李秀成领着数十骑兵在城内飞奔试图堵截湘军，但湘军如潮水一样涌入，如何堵得住？无奈之下，李秀成只好奔向天王府，到后见宫门大开，宫女们纷纷逃出，数以百计的妃嫔蚂蚁般的投河自尽。御河之外，很多逃无可逃的太平天国军民男妇争相投河而死，尸体填溢如桥，水不能流。

　　这时，只见王后赖氏一手牵着洪天贵福，一手拿着剑，踉踉跄跄的从天王府中走出。赖氏看到李秀成后，泪流满面的说：“天王创业一生，想不到今天覆亡，真是天绝我也！这个孩子年纪小，身体弱，就交给忠王你了。”说完，赖氏跃入御河而死。

　　乘着薄暮时分，李秀成一行人带着幼主冒充清军从城破处拼死杀出，沿孝陵卫走入紫金山。但南京城外三百里，到处都是湘军的关卡，李秀成一行人屡次遭遇湘军并发生小规模的战斗，洪天贵福在清凉山外战斗中走散(被李世贤护送)，最后只剩下九人奔入无名荒山之无名小庙，李秀成白天不敢出去，晚上下山取水被附近村民发现，剩余随从被杀。这些土人贪图李秀成携带的珠宝，由于分赃不均，最后闹哄哄的把李秀成扭送到曾国荃的大帐之中。

　　曾国荃随后立刻讯问，李秀成开始不配合，曾国荃大怒，“椎刺其股”，李秀成骂道：“曾九！你不要得志就猖狂，大家彼此不过各为其主，何必如此凌辱于我？”曾国荃狂怒，当场就想把他给宰了。幸好曾国藩的幕僚赵烈文在场，把李秀成带走讯问，问“汝今计安出？”李秀成答：“死矣！”赵烈文发现李秀成“言辞有乞活之意”，便说：“你的罪大，得听朝廷旨意，并非是统帅所能决定的。”李秀成听后俯首不语。

　　曾国藩得到李秀成被俘消息后，急令好生对待，随后赶到金陵亲自讯问李秀成，曾国藩和急躁的弟弟不一样，每日对李秀成“逐日排宴，待以客礼”，还说，你也人中豪杰，没有遇到明主，才落得今天的地步，实在是可惜。李秀成对曾国藩的胸襟有些感动，随后便很配合的在单人囚室里每日奋笔疾书，从六月十七日至二十七日，日书数千言，十日后写成《李秀成自述》。后来此文的真假问题、节气之争，都在史学界掀起了讨论的大热潮。

　　李秀成虽然对曾国藩报有幻想，但终究还是在写完《李秀成自述》后被凌迟处死。参与审理李秀成全过程的赵烈文在日记里记载说，“(李秀成)傍晚赴市，作绝命词，无韵而俚鄙可笑，付监刑庞省三，叙其尽忠之意，遂就诛。”

　　赵烈文也亲眼目睹了湘军攻破天京的全过程，据他的记载，湘军入城后到处杀人抢掠，连二三岁的小孩也不放过，杀之取乐。天京城中，惟见血雨腥风，哀号之声，不绝于耳。在抢掠完之后，湘军开始四处纵火，城中火光冲天，三日不止，“十年壮丽天王府”，老百姓十年的血汗，就这样被烧个一干二净。

　　整个天京，至少有10万多人被杀。中国近代史上，最苦惟有南京人。1853年太平军攻下南京，杀！1864年湘军攻下南京，杀！1937年日本兵攻下南京，更是血海滔天！

　　太平天国十一年，如今尘埃终落定。回望滔滔江水，十三年的血海拼杀，曾国藩终于如愿以偿，成为再造晚清的“中兴第一名臣”。