第二个阶段，史书记载叫“太祖亲理”，太祖指曹操，亲理，就是曹操亲自处理国家大政。这个时候，史书记载曹操是“得病笃重”（《三国志·华佗传》），病得很重了，然后使佗“专视”，召见华佗，专门为自己看病。大家注意这两个词，前边是常在左右，现在发展成“专视”，就是专门为自己看病。前面是一般需求，现在是特殊需求，这两种需求差别很大，层次上差别也很大。那么"太祖亲理"是什么时间呢？据我估计，应当大体在袁绍集团灭亡之后，建安十年以后，曹操掌握了东汉政府的实权，亲自处理朝政。这就是“太祖亲理”。当然随着处理朝政的繁忙，工作的繁忙带来的是曹操的病重，头风病天天发作，这个时候曹操就离不开华佗了，才让他专视。但是，华佗在曹操身边只待了一阵，请假走了。以什么借口请假走的呢？两部史书记载的略有不同。《后汉书》记载，回家取药方；《三国志》记载，收到家信。曹操怎么办？曹操准假，曹操不能不准，你想想他回家取药方，你不让他回家取，他说我没有药方，怎么给你治病？他收到家书，你不让他回去，那肯定不能笼络住华佗之心，曹操准假，让他走了。这是我们所说的请假的理由。

　　但是，《后汉书》在讲华佗请假回去的时候讲了四点理由：第一，华佗此人性格古怪；第二，他内心很不得意；第三，他耻于为医，不愿意当医生；第四，回家，想家。

　　《三国志》的记载只有一个理由，“久远思家归”（《三国志·华佗传》），就是离家时间长，离家远，想回家看看。《三国志》跟《后汉书》记载略有差异，《三国志》成书在前，《后汉书》成书在后。

　　华佗请假回家以后，以他妻子有病为由，多次续假不回去。曹操又是写信催，又是让地方官来催，华佗都不回。最后，曹操急了。这里面就有一个问题，为什么曹操那么催华佗也不回去呢？《三国志》跟《后汉书》的记载都差不多，《三国志》的记载是“佗恃能厌食事”，《后汉书》记载的是“恃能厌事”。这两个记载一样，就是华佗仗着自己的医术高明，不愿意去为曹操一个人服务，结果曹操大怒，派人去查，看他妻子是不是有病，一查，发现他妻子装病。这是欺骗啊，曹操派人就把华佗抓起来，送到许县，投入狱中。华佗投入狱中以后，曹操手下一个重要谋士叫荀彧，曾经劝过曹操，说华佗不能杀，华佗这个人医术太高明了，他的生死关系着多少人的生死，不能杀！结果曹操说了一句非常典型的话，“不忧，天下当无此鼠辈耶？”（《三国志·华佗传》）这句话什么意思呢？别发愁，杀了华佗难道天底下再不能找到像他这样的人吗？但是，据《三国志》记载，他用了一个词“鼠辈”，老鼠的鼠，同辈的辈。鼠辈，找不到像这样的人吗？很看不起华佗。结果，最后是巨星陨落，神医枉死。这就是华佗之死。

　　这就带来一个很大的问题，华佗为什么被曹操杀了？我们读过三国史的人都知道，曹操是爱才、惜才、重才的人，为什么像华佗这样的神医他却要杀掉呢？

　　不知曹操是出于何种心理，他还是杀害了华佗，一个巨星就这样陨落了。而华佗死后，除了五禽戏之外，他的很多东西都没有流传下来，因此后世的人们倍感惋惜。而人们在惋惜之余，也在思考一个问题，曹操一向是以爱才、惜才、重才着称，但他这一次为什么一反常态，杀害医术高超的华佗呢？曹操杀害华佗的真正原因是什么呢？