对新疆的管辖：南疆之治

新疆的南部，与北疆地理环境不同，塔里木盆地中部有面积达32万多平方公里的塔克拉玛干大沙漠，浩瀚无垠的戈壁滩气候干燥，寸草皆无。唯一令人庆幸的是周围高大的雪山流淌着常年不断的雪水，维吾尔人就在塔里木盆地周围开垦出片片绿洲，从事农业生产。因维吾尔人善于种地，准噶尔政权控制南疆时，将当地维吾尔人首领玛罕木特押往伊犁，又迁移数千居民同往，令其种地输粮。伊犁地区的农业开发，维吾尔人有创业之功。

清军尚未结束平定霍集占的叛乱时，乾隆就已经提出对南疆地区实行“因俗而治”的方针。他说：“回部与伊犁不同，伊犁入我版图，控制辽阔，不得不驻兵弹压，至回部平定后，不过拣选头目，统辖城堡，统归伊犁军营节制。”《清高宗实录》，卷570，26页。清政府对南疆实行因俗而治，是其客观条件决定的。南疆周围绝大部分地区与哈萨克、爱乌罕(即阿富汗)、巴达克山等部相邻，这些部落慑于清军兵威，纷纷向清朝纳贡称臣，外境没有强邻压迫。清军在平叛过程中，和阗头人霍集斯、阿克苏头人颇拉特等维吾尔族首领先后归附清朝，仅库车和叶尔羌两城战事激烈，其他地区均不战而降。这种情况使南疆地区原有的行政组织基本上保存下来，可以为清朝利用，因俗而治。

维吾尔人的行政机构。乾隆二十四年(1759年)，定边将军兆惠指挥清军攻下叶尔羌、喀什噶尔两城后，向乾隆报告了当地的行政机构情况。据他说：“查回部头目，曰阿奇木，总理一城；曰伊沙罕，协办阿奇木事；曰商伯克，管理租赋；曰哈子，管理刑名；曰密喇布，管理水利；曰讷克布，管理匠役；曰帕察沙布，查拏贼盗；曰茂特色布，承办经教；曰本特斡里，管理田宅；曰都管，管理馆驿；曰巴济格尔，管理税课；曰阿尔布巴，派差催课；曰市珲，协办都管事；曰巴克迈塔尔，专管园林；曰明伯克，其职如千总。”《清高宗实录》，卷593，12页。由此可知，南疆各城自阿奇木伯克以下，有一套比较完整的行政系统。大小伯克及其属吏占有大量土地，役使维吾尔人民种地交租，他们还利用南疆地处丝绸之路孔道的便利，向来往商人征税。南疆地区还自行铸造货币，即“普尔钱”，通行各地。