佛教和道教文化的不少因素也渗透到东巴教中，其中比较典型的表现是东巴教的丧葬仪式。东巴教接受了佛教“三界六道”说，绘制了描述生命历程的鸿篇巨制“神路图”，并把它运用于丧葬超度仪式。但这种佛教观念并未取代本民族传统的生命归宿观，而是形成了一种传统与外来文化因素并存的丧葬文化，与纳西族传统的“回归祖地”生命归宿观并存于东巴教教义中
东巴教中的哲学思想
东巴教中有不少睿智而朴素的哲学思想，如“人类卵生说”、“声气化生物类说”、“声、气、白露大海化生人类祖先说”、“雌雄二元化生万物说”、“三生九、九出母体说”、“天圆地方、天地空间为五方”的宇宙结构观念等。这些都是研究中国古代哲学思想史和进行民族哲学思想比较研究的珍贵资料。东巴教中“人和大自然是同父异母两兄弟”的神话故事及相关仪式“署古”突出反映了纳西人的自然观。东巴经《挽歌》则充分体现了豁达的生死观念，即世上没有一种生灵能永远活在世上，人间也找不到一个生命能千年万年长生不老。
另外，东巴教的“青蛙阴阳五行说”融汇了纳西先民的时空方位观念，形成了融宗教与哲学、天文等文化因素于一体的思想体系，对纳西族古代文化和社会生活有重大影响。东巴经中有140多个有关天象、时令、 方位的象形字，记录了诸多星座的名称。
