一只南美洲亚马逊河流域热带雨林中的蝴蝶，偶尔扇动几下翅膀，可能在两周后引起美国得克萨斯的一场龙卷风。---这就是现代西方有名的蝴蝶效应理论，它观点是一个小的事情可能会最终引起大的波澜。

崇祯四年冬夜的吴桥县，因为一只鸡的归属引起的纠纷，竟让明朝苦心训练的一支军队反叛，而这次反叛又不是一次普通事件，它最终还会影响到明帝国的命运、乃至中国的命运。

在离京畿如此之近的地方闹起了兵变，而且兵变的士兵携带有当时最先进的武器，这不啻一个惊雷，朝廷敕令山东、登莱两巡抚迅速解决此事，刚刚用粮饷再次解决了皮岛兵变的孙元化，似乎并没有慌乱，按照他的经验，只要粮饷发足，并不追究责任，兵变就很快能够解决。他让孔有德率部回登州，一切都好商量。而且孙元化与山东巡抚余大成联合发布命令，从吴桥至登州一路州县，不得出兵阻击孔有德。孔有德似乎也听从了孙元化的命令，虽然一路还是抢掠不断，但还是向着登州方向归来。沿途州县也不敢拦截，让出通道让孔有德部通过，其中虽然孔有德部一度进入了当地驻军的伏击圈，由于没有攻击命令，使其逃脱，错失了歼灭叛军的良机，当孔有德走到莱州府时，以前与孔有德交往甚厚的莱州知府朱万成却紧闭城门，让孔有德绕城而过，他已经识破了孔有德的诡计。果然，来到登州城下的孔有德部，突然亮出了诈降的真面目，开始攻打登州城。

登州城从名将戚继光的祖父辈就开始修建、完善的军港重镇，它本来的作用是为了抗击倭寇，同时也是明朝的海军基地，登州城三面是依海边的山势峭壁而建的陆地城墙，城头排列着当时各种最先进的西洋火炮，一面是水城，城中有内港小海，停泊战船，尤其是不久前，朝鲜国王赠送给孙元化的40艘战船，此时应该也正停泊在港内(不知道有没有朝鲜著名的龟船)。城中的守军，一是由当时的军事理论家、登州总兵张可大率领的浙江兵，浙兵是一支有着戚家军传统的军队，二是，教授明军操作西方火器的葡萄牙军官团，三是与孔有德叛军同样出身的辽东兵。无论从城防设施，还是兵员素质，登州都可谓是固若金汤。但即使事情到了这个地步，孙元化还没有放弃招抚叛军的念头，这也束缚住了他自己的手脚，不敢放手与叛军坚决一战，在张可大的浙兵军团稍尝胜果后，孙元化就下令停战，叛军抓住这个机会反扑，击败了张可大。同时也俘获了很多登州城中的辽东兵，而且登州辽东兵开始出现了倒戈。

这时辽东兵军官中与孔有德并称“山东三矿徒”的第二个人耿仲明，正在登州城中被关禁闭隔离审查，---他的弟弟参与了不久前的第二次皮岛兵变。由于正时用人之际，孙元化让他戴罪立功，孙元化没想到的是，孔有德已经让登州的辽东兵降卒，潜回登州来策反耿仲明。崇祯五年的春节之夜，辽东兵军官耿仲明和陈光福，从内策应打开城门，叛军从登州东门一拥而入---坚固的堡垒总是从内部被攻破，此言不虚。登州沦陷，总兵张可大自杀殉国，孙元化却陷入了两难，一方面他是一个儒生，儒家教育要求他舍生取义，同时他又是一个天主教徒，天主教义要求他爱惜自己不能自残。孙元化选择了自刎却并没有死，他被救了过来。孔有德先是要求孙元化做带头大哥，领着他们造反建立自己的政权。被孙元化严词拒绝后，念及孙元化以前的收留提携之恩，将孙元化释放。同时被俘的还有蓬莱县令、参议、总兵、参将等一大批官员，总教习特谢拉?科雷亚等12名葡萄牙军官战死，他们最终都被明廷追授、抚恤。不仅如此，孔有德在此役中还掳获了旧兵六千人、援兵千人、马三千匹、饷银十万两、红夷大炮二十多门，西洋炮三百门，其余火器和甲仗，不可胜数，可以说这个辽东前线的后勤基地中堆积如山的物资，全成为了叛军的囊中之物。叛军还将城中的居民驱赶到东门外，大肆屠杀，残杀百姓数以万计，一时间血流成河生灵涂炭。