在镇压太平军中扶摇直上

咸丰皇帝登基当年（1851年)，轰轰烈烈的太平天国运动在广西桂平爆发。34岁的冯子材在剿灭凌十八部之后，奉令募兵500人，号称“常胜勇”，奔赴广西参与镇压太平军。

冯子材有勇有谋，先后被提拔为外委把总、把总、补用千总，崭露头角。

太平军从广西北上后，冯子材作为广西提督向荣的部属，一直尾随太平军至江南。途中多次参加战斗，勇猛异常，备受顶头上司张国梁器重，免补千总而升守备、都司、游击、参将、副将、总兵，一路攀升，飞黄腾达。

1860年，43岁的冯子材在江苏镇江保卫战中击退太平军的围攻，获赏提督衔，并督办镇江军务，守卫镇江。两年后，以广西提督身份继续守御镇江，阻扼太平军从天京（今江苏南京)沿长江东下上海等地。

三次出关靖边

成为统兵大员后，冯子材率部攻下了太平军占据的重镇丹阳，受到清廷的嘉奖。

太平天国失败后，冯子材于1865年奉命前往广东罗定、信宜剿灭当地反清队伍。两个月后事竣，始赴广西提督本任。

此后18载，冯子材在广西提督任上连连用兵，翦除各地反清武装，并3次率兵赴越南，追剿入越的反清队伍。

首次赴越时在1869年，目的是追击吴亚忠率领的反清农民军。攻下吴部占领的地盘及吴战死后，于当年班师回国。途中吴部将梁天锡降而复叛，冯回师继续追剿，事平后于翌年回国。

1871年，因越南边境战乱，藩属国越南无法向宗主国清朝进贡，冯子材再次奉命带兵出关，平定战乱，疏通贡道后于当年入关。

1878年，冯子材旧部副将李扬才因官场失意，便以恢复越南李氏祖业为由，率军入越颠覆越南阮氏王朝的江山。冯子材第三次奉命入越讨李，次年生擒李扬才，并全歼李军之后率师回国。

冯子材就任广西提督期间，弹劾过贪官污吏，伸张过正义。但官场风云险恶，当错综复杂的人际关系弄得冯子材晕头转向时，他只好告病还乡，暂时结束了长达20多年的提督生涯。